幼年时，主人公直枝理树因双亲去世而陷入自闭。某日，时常被痛苦所萦绕的少年眼前，突然出现了四个男孩。自称名为“LITTLE BUSTERS”的他们宣布由于世界又要毁灭了，不得不借助这个大孩子的力量来拯救世界。随即，他们来到了近处的蜜蜂巢穴，与蜜蜂们展开了搏斗.最终弄得浑身被蜇伤，又引起了火灾，召唤来了救护者救火车和无数大人。结果是，四人中有一个是女孩子。然后四男一女被校长狠狠地训斥了一顿。但也由此，他们5个开始了充满阳光的愉快生活。虽然少年经常被他们所造成的骚动卷入，但渐渐忘记了自己的寂寞和伤痛，无忧无虑地沉浸在新生活之中，想着“这样的时光能永远延续下去就好了”。长大后五人一同进了全宿制高中，某日，高三的恭介提议组建棒球队，为了凑够人数而大家开始寻找队员，在这之中，主角理树遇见了主要的女生角们。
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